มหาวิทยาลัยขอนแก่น มีการจัดตั้งสภาพพนักงานมหาวิทยาลัยขอนแก่น เพื่อเป็นองค์กรตัวแทนของพนักงานมหาวิทยาลัย ทำหน้าที่เป็นปากเป็นเสียงในการเจรจาต่อรองกับผู้บริหาร เพื่อเรียกร้องและปกป้องสิทธิประโยชน์ของสมาชิก เช่น การปรับปรุงโครงสร้างเงินเดือน การเพิ่มสวัสดิการ และการปรับปรุงสภาพการจ้างงานให้เป็นธรรมยิ่งขึ้น การมีอยู่ของสหภาพเป็นเครื่องยืนยันว่า มข. เป็นองค์กรที่เปิดกว้างและเคารพในกระบวนการแรงงานสัมพันธ์ตามระบอบประชาธิปไตย หากบุคลากรไม่ได้รับความเป็นธรรม จะมีช่องทางในการร้องเรียนผ่าน “คณะกรรมการพิจารณาเรื่องร้องทุกข์” ของมหาวิทยาลัย ซึ่งเป็นกลไกภายในที่ทำหน้าที่ไกล่เกลี่ยและหาข้อยุติอย่างเป็นธรรม เนื่องจากมหาวิทยาลัยขอนแก่น เป็นองค์กรใหม่ มีบุคลากรหลากหลายกลุ่ม ทั้งประเภทพนักงานมหาวิทยาลัย ข้าราชการ ลูกจ้าง และหากจำแนกตามประเภทบุคลากรจะพบว่ามีทั้งบุคลากรที่เป็นคนไทยและคนต่างชาติเป็นเพศชายและหญิงรวมถึงกลุ่มที่ถูกมองข้าม
